Google DeepMind a annoncé le 11 novembre AlphaGenome 2, un modèle d’analyse de l’ADN qui prédit comment les modifications de l’ADN peuvent affecter certains types cellulaires et qui est accessible aux chercheurs à des fins non commerciales.
D’autres modèles calculent une moyenne de l’activité sur de vastes groupes de tissus, tandis qu’AlphaGenome 2 peut produire des prédictions pour un type ou un état cellulaire donné. Cela aide les chercheurs à déterminer si une même modification de l’ADN agit différemment selon les cellules. DeepMind indique avoir entraîné le modèle sur plus de 100 millions de profils de cellules individuelles issus de 68 tissus.
Le modèle peut également prendre en entrée une séquence d’ADN comptant jusqu’à un million de lettres, ainsi que des informations sur une condition biologique. Lors du test qu’elle a rapporté, mené à l’aide du jeu de données de cellules immunitaires TenK10K, l’entreprise a constaté qu’AlphaGenome 2 identifiait 30 % des modifications de l’ADN ayant un effet. Son modèle précédent, qui avait été davantage entraîné à l’aide de données unicellulaires, en avait identifié 16 %.
Ces résultats sont rapportés par l’entreprise et ne montrent pas que le système peut diagnostiquer ou traiter une maladie. Les chercheurs peuvent accéder au modèle par l’intermédiaire de l’API AlphaGenome pour des travaux de recherche non commerciale. L’accès destiné à la recherche commerciale est proposé dans le cadre d’une préversion privée.
DeepMind le présente comme un outil destiné à aider les scientifiques à étudier le fonctionnement des maladies, et non comme un produit à usage clinique.